玉米萌发期耐盐性状全基因组关联分析与基因组选择预测研究
  • ISSN:3135-7571(Print) 3135-758X(Online)
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玉米萌发期耐盐性状全基因组关联分析与基因组选择预测研究

邹浩勇 余泽琼 闫学勤

浙江农林大学 浙江 杭州 310000

摘要:【摘 要】:土壤盐渍化制约玉米种子萌发与苗期建成,发掘萌发期耐盐遗传位点、构建高效基因组预测模型是耐盐玉米分子育种关键路径。本试验选用 268 份玉米自然自交系为试验材料,设置 0(CK)、80 mmol/L、160 mmol/L NaCl 三个盐浓度梯度开展萌发试验,测定发芽率、发芽势、胚根长、胚芽长 4 项耐盐相关指标;利用 55K SNP 芯片完成基因型分型,开展全基因组关联分析(GWAS)挖掘显著关联 SNP 位点,结合 GBLUP、RRBLUP 两种基因组选择算法,评价不同性状全基因组预测准确度。结果表明:随盐浓度升高,玉米各项萌发指标显著下降,不同自交系耐盐性状存在极显著基因型差异;GWAS 共筛选得到 29 个与萌发耐盐显著关联 SNP 标记,分布于玉米 1~10 号染色体,注释得到 17 个耐盐候选基因;基因组选择中 RRBLUP 模型整体预测精度高于 GBLUP,发芽率预测准确度最高可达 0.723。研究明确了玉米萌发期耐盐遗传位点与高效预测模型,可为玉米耐盐分子标记辅助育种、全基因组选择育种提供理论依据与基因资源。

关键词:【关键词】:玉米;萌发期;耐盐性;全基因组关联分析;基因组选择;SNP 标记

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